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《最高指挥官：钢铁联盟》是由 Gas Powered Games 制作，台湾松岗科技代理的一款即时战略类游戏，承接《最高指挥官》的剧情，耳尖的玩家会在结局听到关于新威胁的消息，这支异星种族正是「瑟拉芬」，「瑟拉芬」并非如同主程式中所描述的这么友善。「塞布兰国」的「量子人工智能(QAI)」不知为何居然背叛布雷克曼博士，在地球开启了一道「量子裂缝」。
《钢铁同盟》（Forged Alliance），以独立资料片形式发行。《钢铁同盟》包含一个新的阵营、新的单人战役和百余种新式单位，游戏内容和接口上也做了改良与更新。
新种族「瑟拉芬」使用的科技与其他人类阵营不同，连兵种单位的造型也十分独特，他们利用「负能量」作为武器，甚至在武器中包含一种怪异的「能源生物」，比如说「瑟拉芬」的重型火炮能发射的能源弹药会释放出这种「能源生物」攻击敌人，他们的突击机器人也具备这种特色，即使被摧毁，留下来的能源生物仍然会持续攻击附近敌方单位一段时间。「瑟拉芬」入侵地球的巨大飞行物则是实验性轰炸机，这种轰炸机投射的能量炸弹等同于小型核弹，威力奇大无比，光是一架就足以移平整座基地，而且它还配备三门防空自动炮，就算面对大批空优战机也有自保的能力。
为了对抗异星种族的威胁，三方人类阵营在军事科技上也互有交流，每个阵营多了10种新单位，其中包含一个全新的实验性单位。举例来说，「塞布兰国」终于有了属于自己的科技等级三炮艇，相信对「UEF」的重型炮艇有更好的反击能力。此外，像是点防御、鱼雷发射器等防御性单位也强化至科技等级三，海军单位有新的「反潜艇」船舰、「匿踪力场产生器」船舰...等，空军单则有能运送更多部队的「重型运输艇」等等。而从目前透露的新实验性单位，「塞布兰国」的蜘蛛机器人已经不够看，布雷克曼博士最新研发的「巨石」是蜘蛛机器人的两倍大，这种外形像螃蟹的两栖作战单位配备两门质子加农炮和防空武器，以及鱼雷发射器和反鱼雷爆弹，光是一具就能歼灭整批海军舰队，不仅如此，它也是座机动工厂，能够生产地面单位和小型船舰，一但「巨石」生产成功，将会是敌人难以招架的强兵利器。
《最高指挥官：钢铁同盟》也在游戏画面和特效有大幅的进步，单位的贴图和细节更为丰富，增加新的爆炸特效、高热产生的模糊效果以及光影处理。