《异教徒 II》是一款第三人称的幻想射击游戏，镜头在人物背后追逐。这种视角几乎是唯一打破该系列传统的地方。核心玩法仍然主要包括探索大型幻想主题关卡，使用中世纪的武器（主要是远程）和法术来对付大量的敌人。尽管是第三人称视角，但跳跃和环境谜题的使用与第一人称射击游戏中的通常做法一样适度。

中世纪的帕索里斯土地被一场神秘的瘟疫所席卷。其受感染的居民陷入疯狂。第一部《异教徒》的主人公科沃斯找到了逃离家乡的方法，但仍被瘟疫所感染。由于他拥有一本古老的《力量之书》，他不会立即受到瘟疫的影响；但他迟早会屈服于瘟疫。在这之前，科沃斯必须先找到造成瘟疫的人或物……